用包埋剂来支持组织的过程称为包埋，最常用的是石蜡包埋。包埋关键一是平整，二是方位。要求在包埋时，用镊子轻压组织块拱起部位，使之平贴于底部，通常采用组织的最大面包埋。囊胚官腔组织应竖直包埋。小块多颗粒组织应尽量放在一起，并保持在同一个平面上。修去两边的余腊，包埋时还应该注意有无缝隙，纸屑，如果有一定要去除，留有杂质的石蜡，容易造成污染和刀口受损。腊的熔点应在56-58℃之间选择，融蜡的温度在60-61℃左右。